Ahli ekologi penyakit satwa liar meluncurkan proyek untuk membantu DoD memantau kualitas habitat burung di instalasi militer
Ahli ekologi penyakit satwa liar meluncurkan proyek untuk membantu DoD memantau kualitas habitat burung di instalasi militer
Departemen Pertahanan AS (DoD) memiliki instalasi militer di hampir 27 juta hektar di seluruh negeri—kira-kira setara ukurannya dengan Virginia—dan mengawasi tanah-tanah ini melalui jaringan pengelola sumber daya alam. Menurut DoD, program tersebut mendukung "misi pengujian dan pelatihan militer dengan melindungi sumber daya hayatinya... dan bekerja untuk memastikan keberlanjutan jangka panjang dari warisan alam bangsa kita yang tak ternilai harganya." Salah satu prioritas utama program ini adalah memantau dan memelihara populasi spesies burung yang terancam dan terancam punah (TES)—terutama yang memakan serangga dan arthropoda lain seperti laba-laba, yang sangat terpukul.
Memantau kualitas habitat burung, termasuk pola makan serangga yang khas, adalah salah satu cara paling penting para ilmuwan menyelidiki penurunan populasi burung. Alat yang digunakan pengelola lahan militer untuk menilai pola makan dan habitat sangat penting, tetapi metode saat ini untuk mengukur kualitas habitat yang terkait dengan sumber makanan burung memakan waktu, mahal dan memerlukan keahlian biologis khusus.
Untuk tujuan ini, associate professor Jeff Foster dari Departemen Ilmu BiologiUniversitas Arizona Utara dan Institut Patogen dan Mikrobioma (PMI) baru-baru ini dianugerahi hibah oleh DoD untuk studi baru, "Demonstrasi Metabarcoding untuk Memantau Kualitas Habitat Spesies Burung pada Instalasi DoD." Proyek tiga tahun senilai $900.000 ini akan berfokus pada lima spesies pemakan serangga di empat situs militer:
• Warbler pipi emas (Setophaga chrysoparia) dan Vireo (Vireo atricapilla) yang tertutup hitam di Fort Hood, Texas
• Least Bell's Vireo (Vireo bellii pusillus) di Camp Pendleton, California
• Warbler bersayap emas (Vermivora chrysoptera) di Fort McCoy, Wisconsin
• Oahu Elepaio (Chasiempis ibidis) di Barak Schofield, Hawaii
Pendekatan lanjutan berfokus pada bioinformatika, metabarcoding
Metabarcoding adalah teknik yang memungkinkan para ilmuwan untuk mengidentifikasi beberapa spesies tanaman atau hewan dalam skala besar berdasarkan pengurutan DNA lingkungan yang cepat dan throughput tinggi, yang mewakili langkah maju teknologi yang sangat besar.
"Kami akan menilai kualitas habitat dengan menggunakan pendekatan genetik canggih untuk mengukur sumber makanan arthropoda dalam makanan burung dan dari vegetasi tempat burung-burung ini mencari makan," kata Foster. "Tiga tujuan utama kami adalah untuk menunjukkan efektivitas metabarcoding diet burung dan sumber daya makanan; membandingkan pendekatan genetik ini dengan pendekatan konvensional yang menggunakan identifikasi visual arthropoda menggunakan mikroskop; memberikan panduan yang mudah digunakan kepada pengelola lahan militer sehingga mereka dapat memahami prosesnya dan menggunakan pendekatan ini untuk pemantauan di masa mendatang.
"Bioinformatika dapat menjadi tantangan dan menakutkan jika Anda pertama kali masuk ke metabarcoding DNA, jadi kami akan menyediakan alur kerja yang mapan yang dapat kami bagikan dengan manajer lahan."
Tim akan mengumpulkan sampel tinja dari sampel burung (kotoran burung) dan arthropoda, melakukan analisis komposisi bioinformatik dan kimia, memvalidasi teknologi dengan membandingkannya dengan metode konvensional, mengembangkan dokumen panduan dan memimpin lokakarya teknis langsung untuk manajer lahan militer. Ini akan menjadi analisis diet burung yang paling mendalam di instalasi militer yang dilakukan hingga saat ini.
Foster membawa keahliannya serta PMI ke dalam proyek. "Ada lebih banyak pekerjaan metabarcoding daripada sekadar mengurutkan gen. Dan di sinilah tim kami unggul. Kami menggunakan alat yang dikembangkan selama 13 tahun terakhir untuk menganalisis mikrobioma manusia. Profesor NAUGreg Caporaso dantimnya di PMI telah mengembangkan banyak alat ini, jadi kami memiliki keahlian teknis yang cukup besar dalam analisis, termasuk memahami pustaka referensi urutan dan mengembangkan perangkat lunak analitis."
Kolaborator termasuk ilmuwan militer dan peneliti sarjana
Foster akan bekerja sama dengan penyelidik utama bersama Jinelle Sperry dan Aron Katz dari Laboratorium Penelitian Insinyur Insinyur Korps Insinyur Angkatan Darat A.S. Laboratorium Penelitian Insinyur Konstruksi Pusat Penelitian dan Pengembangan, serta dengan kolaborator di masing-masing instalasi.
Peneliti sarjana NAU Hannah Brosius sedang mengerjakan proyek ini bersama Foster dan peneliti PMI Alexandra Gibson. Brosius, yang akan membantu pekerjaan laboratorium dan analisis, mengatakan, "Saya senang dengan proyek ini karena analisis diet burung dari kotoran akan membantu kami mencari tahu mengapa burung yang terancam punah ini mungkin berisiko. Sangat menyenangkan bisa mengambil sampel tinja dari suatu spesies; Anda dapat belajar banyak menggunakan DNA untuk memahami bagaimana seekor binatang hidup."
Dia menantikan masa depannya sebagai dokter hewan. "Saya tertarik dengan pekerjaan laboratorium, yang memungkinkan saya untuk fokus pada sebuah proyek dan mendapatkan hasil dengan cepat. Pengalaman penelitian ini akan menjadi penting bagi sekolah kedokteran hewan dan akan memperluas pemahaman saya tentang biologi."
Proyek untuk memberi manfaat bagi pemantauan TES di seluruh situs DoD
Hasil proyek akan memiliki banyak manfaat yang akan membantu pengelola lahan DoD memantau spesies yang terancam dan terancam punah.
"Ini adalah cara yang efektif dan hemat biaya untuk mengukur kualitas habitat, terutama yang berkaitan dengan faktor kunci yang mengatur kelimpahan burung pemakan serangga—sumber makanan arthropoda," kata Foster. "Teknologi ini dapat digunakan di lokasi DoD mana pun di mana pemahaman diet atau kualitas habitat diperlukan untuk pemantauan TES terhadap taksa vertebrata. Survei populasi dapat menilai kelimpahan dan distribusi TES saat ini tetapi menentukan faktor-faktor spesifik yang membatasi populasi mereka menambah kompleksitas tambahan. Metode ini tidak hanya akan memberi manajer sumber daya alam DoD kemampuan untuk membedakan habitat yang buruk versus habitat berkualitas tinggi, tetapi juga akan memberikan informasi penting tentang restorasi, pemulihan habitat dari gangguan dan dasar ketersediaan mangsa jika populasi arthropoda menurun secara regional di masa depan."
Selain itu, banyak spesies burung lain ada dalam daftar Spesies Prioritas DoD dan dapat memperoleh manfaat dari teknologi ini serta taksa lainnya seperti amfibi, reptil, dan mamalia kecil.
Tentang Universitas Arizona Utara
Didirikan pada tahun 1899, Northern Arizona University adalah universitas riset tinggi yang melibatkan komunitas yang memberikan pengalaman luar biasa yang berpusat pada siswa kepada hampir 28,000 mahasiswanya di Flagstaff, di 22 kampus di seluruh negara bagian dan online. Dibangun di atas sejarah 123 tahun keunggulan yang khas, NAU bertujuan untuk menjadi mesin peluang utama bangsa, kendaraan mobilitas ekonomi dan pendorong dampak sosial dengan memberikan nilai postecondary yang adil di Arizona dan sekitarnya. NAU berkomitmen untuk memenuhi bakat dengan akses dan keunggulan melalui program akademiknya yang berdampak dan memperkaya pengalaman, membuka jalan menuju masa depan yang lebih baik bagi beragam siswa yang dilayaninya dan komunitas yang mereka wakili.
Departemen Pertahanan AS (DoD) memiliki instalasi militer di hampir 27 juta hektar di seluruh negeri—kira-kira setara ukurannya dengan Virginia—dan mengawasi tanah-tanah ini melalui jaringan pengelola sumber daya alam. Menurut DoD, program tersebut mendukung "misi pengujian dan pelatihan militer dengan melindungi sumber daya hayatinya... dan bekerja untuk memastikan keberlanjutan jangka panjang dari warisan alam bangsa kita yang tak ternilai harganya." Salah satu prioritas utama program ini adalah memantau dan memelihara populasi spesies burung yang terancam dan terancam punah (TES)—terutama yang memakan serangga dan arthropoda lain seperti laba-laba, yang sangat terpukul.
Memantau kualitas habitat burung, termasuk pola makan serangga yang khas, adalah salah satu cara paling penting para ilmuwan menyelidiki penurunan populasi burung. Alat yang digunakan pengelola lahan militer untuk menilai pola makan dan habitat sangat penting, tetapi metode saat ini untuk mengukur kualitas habitat yang terkait dengan sumber makanan burung memakan waktu, mahal dan memerlukan keahlian biologis khusus.
Untuk tujuan ini, associate professor Jeff Foster dari Departemen Ilmu BiologiUniversitas Arizona Utara dan Institut Patogen dan Mikrobioma (PMI) baru-baru ini dianugerahi hibah oleh DoD untuk studi baru, "Demonstrasi Metabarcoding untuk Memantau Kualitas Habitat Spesies Burung pada Instalasi DoD." Proyek tiga tahun senilai $900.000 ini akan berfokus pada lima spesies pemakan serangga di empat situs militer:
• Warbler pipi emas (Setophaga chrysoparia) dan Vireo (Vireo atricapilla) yang tertutup hitam di Fort Hood, Texas
• Least Bell's Vireo (Vireo bellii pusillus) di Camp Pendleton, California
• Warbler bersayap emas (Vermivora chrysoptera) di Fort McCoy, Wisconsin
• Oahu Elepaio (Chasiempis ibidis) di Barak Schofield, Hawaii
Pendekatan lanjutan berfokus pada bioinformatika, metabarcoding
Metabarcoding adalah teknik yang memungkinkan para ilmuwan untuk mengidentifikasi beberapa spesies tanaman atau hewan dalam skala besar berdasarkan pengurutan DNA lingkungan yang cepat dan throughput tinggi, yang mewakili langkah maju teknologi yang sangat besar.
"Kami akan menilai kualitas habitat dengan menggunakan pendekatan genetik canggih untuk mengukur sumber makanan arthropoda dalam makanan burung dan dari vegetasi tempat burung-burung ini mencari makan," kata Foster. "Tiga tujuan utama kami adalah untuk menunjukkan efektivitas metabarcoding diet burung dan sumber daya makanan; membandingkan pendekatan genetik ini dengan pendekatan konvensional yang menggunakan identifikasi visual arthropoda menggunakan mikroskop; memberikan panduan yang mudah digunakan kepada pengelola lahan militer sehingga mereka dapat memahami prosesnya dan menggunakan pendekatan ini untuk pemantauan di masa mendatang.
"Bioinformatika dapat menjadi tantangan dan menakutkan jika Anda pertama kali masuk ke metabarcoding DNA, jadi kami akan menyediakan alur kerja yang mapan yang dapat kami bagikan dengan manajer lahan."
Tim akan mengumpulkan sampel tinja dari sampel burung (kotoran burung) dan arthropoda, melakukan analisis komposisi bioinformatik dan kimia, memvalidasi teknologi dengan membandingkannya dengan metode konvensional, mengembangkan dokumen panduan dan memimpin lokakarya teknis langsung untuk manajer lahan militer. Ini akan menjadi analisis diet burung yang paling mendalam di instalasi militer yang dilakukan hingga saat ini.
Foster membawa keahliannya serta PMI ke dalam proyek. "Ada lebih banyak pekerjaan metabarcoding daripada sekadar mengurutkan gen. Dan di sinilah tim kami unggul. Kami menggunakan alat yang dikembangkan selama 13 tahun terakhir untuk menganalisis mikrobioma manusia. Profesor NAUGreg Caporaso dantimnya di PMI telah mengembangkan banyak alat ini, jadi kami memiliki keahlian teknis yang cukup besar dalam analisis, termasuk memahami pustaka referensi urutan dan mengembangkan perangkat lunak analitis."
Kolaborator termasuk ilmuwan militer dan peneliti sarjana
Foster akan bekerja sama dengan penyelidik utama bersama Jinelle Sperry dan Aron Katz dari Laboratorium Penelitian Insinyur Insinyur Korps Insinyur Angkatan Darat A.S. Laboratorium Penelitian Insinyur Konstruksi Pusat Penelitian dan Pengembangan, serta dengan kolaborator di masing-masing instalasi.
Peneliti sarjana NAU Hannah Brosius sedang mengerjakan proyek ini bersama Foster dan peneliti PMI Alexandra Gibson. Brosius, yang akan membantu pekerjaan laboratorium dan analisis, mengatakan, "Saya senang dengan proyek ini karena analisis diet burung dari kotoran akan membantu kami mencari tahu mengapa burung yang terancam punah ini mungkin berisiko. Sangat menyenangkan bisa mengambil sampel tinja dari suatu spesies; Anda dapat belajar banyak menggunakan DNA untuk memahami bagaimana seekor binatang hidup."
Dia menantikan masa depannya sebagai dokter hewan. "Saya tertarik dengan pekerjaan laboratorium, yang memungkinkan saya untuk fokus pada sebuah proyek dan mendapatkan hasil dengan cepat. Pengalaman penelitian ini akan menjadi penting bagi sekolah kedokteran hewan dan akan memperluas pemahaman saya tentang biologi."
Proyek untuk memberi manfaat bagi pemantauan TES di seluruh situs DoD
Hasil proyek akan memiliki banyak manfaat yang akan membantu pengelola lahan DoD memantau spesies yang terancam dan terancam punah.
"Ini adalah cara yang efektif dan hemat biaya untuk mengukur kualitas habitat, terutama yang berkaitan dengan faktor kunci yang mengatur kelimpahan burung pemakan serangga—sumber makanan arthropoda," kata Foster. "Teknologi ini dapat digunakan di lokasi DoD mana pun di mana pemahaman diet atau kualitas habitat diperlukan untuk pemantauan TES terhadap taksa vertebrata. Survei populasi dapat menilai kelimpahan dan distribusi TES saat ini tetapi menentukan faktor-faktor spesifik yang membatasi populasi mereka menambah kompleksitas tambahan. Metode ini tidak hanya akan memberi manajer sumber daya alam DoD kemampuan untuk membedakan habitat yang buruk versus habitat berkualitas tinggi, tetapi juga akan memberikan informasi penting tentang restorasi, pemulihan habitat dari gangguan dan dasar ketersediaan mangsa jika populasi arthropoda menurun secara regional di masa depan."
Selain itu, banyak spesies burung lain ada dalam daftar Spesies Prioritas DoD dan dapat memperoleh manfaat dari teknologi ini serta taksa lainnya seperti amfibi, reptil, dan mamalia kecil.
Tentang Universitas Arizona Utara
Didirikan pada tahun 1899, Northern Arizona University adalah universitas riset tinggi yang melibatkan komunitas yang memberikan pengalaman luar biasa yang berpusat pada siswa kepada hampir 28,000 mahasiswanya di Flagstaff, di 22 kampus di seluruh negara bagian dan online. Dibangun di atas sejarah 123 tahun keunggulan yang khas, NAU bertujuan untuk menjadi mesin peluang utama bangsa, kendaraan mobilitas ekonomi dan pendorong dampak sosial dengan memberikan nilai postecondary yang adil di Arizona dan sekitarnya. NAU berkomitmen untuk memenuhi bakat dengan akses dan keunggulan melalui program akademiknya yang berdampak dan memperkaya pengalaman, membuka jalan menuju masa depan yang lebih baik bagi beragam siswa yang dilayaninya dan komunitas yang mereka wakili.
."¥¥¥".
."$$$".
Comments
Post a Comment
Informations From: Omnipotent